今日の測定はサンプルがことごとくダメで、疲れただけで成果がなかった…… アニメ 「機動戦士ガンダム 水星の魔女」を 23 話まで見たが、しばらく前から登場人物の思惑や関係性が分からなくなってるし、戦闘も最初の頃みたいに駆け引きや工夫があるわけじゃな…

夕方、大学構内でセミらしき声を今年はじめて耳にした。 Screenshot an area into the clipboard Ubuntu 22.04 LTS では、(前バージョンにあった)範囲を選択してクリップボードへスクリーンショットを撮る機能が消滅。 議論されてはいるが 1 年も経つのに未…

今日は朝から室温が 30 度ある……。すっかり蒸し暑くなったので、昨日からラボの居室も冷房を入れた。 ドイツ語や、ドイツ語話者の英語を聞いていると、語尾の en とかがどうも鼻に抜けているように聞こえることがあって、ドイツ語には鼻母音がないはずなのに…

古いマシン(Ethernet)から新しいマシン(Wifi)へ論文ファイルを rsync していたら、頻繁に broken pipe。 しかし、受け手が行っている他の通信は切断されなかった。受け手を有線にしたら安定した。謎。 → 2023/07/03 に続報あり。 MicroED datasets on XRDa X…

今朝は 5 時に悪夢を見て目が醒めた……。日中も妙に疲れていて、論文を読むにもあまり集中できなかった。 スキャンした古い書類を二値化したかったので、"Binarize an image" にしたがって convert original.jpeg -crop wxh+x+y -colorspace gray -auto-level…

今日も疲れていたのでずいぶん昼寝をしたが、昼寝をしすぎたのかまだ眠たいのに頭が痛くなったので、座って本を読んでいた。 大正時代の本を読んでていて出てきた難しい語彙: 刪潤 さんじゅん(さつじゅんではない): 文章を削ったり足したりして推敲する 遒勁…

今日はつかれたので長時間昼寝してた。 読んだ CNN "Putin is at risk of losing his iron grip on power. The next 24 hours are critical" 興味深いことになったな。

BOOTH でアマチュアの方の小説を購入。とりさんは普段電子書籍を購入することに大反対しており、紙の本で買っているが、それは Kindle など独自形式になっていてプラットフォームが潰れたら読めなくなるやつの場合。PDF で手元におけるならこうやって購入す…

RHEL の source code が限定公開になる件で世間が騒がしい(1, GPL の影響, 2)。とりは、たしか中学・高校の頃は Red Hat 系である Vine Linux を使っていたが、Fedora が出て間もない頃に試して yum のあまりの遅さに発狂し、それ以来 Debian 系を使うように…

月曜日くらいから徐々に精神状態も体調も悪化。足はだるいし背中も痛い。しかも今日は、急に 250 TB ものデータをどこかに移さないといけなくなって、その受け皿を探すことになけなしのエネルギーを使い果たしたorz "How to manually set the "In-Reply-To" …

読んだ Angewandte Chemie "Cis–Trans Reisomerization Precedes Reprotonation of the Retinal Chromophore in the Photocycle of Schizorhodopsin 4" セミナーでこの話を聞いた。共鳴ラマン分光法自体には詳しくないので、解釈の妥当性については判断でき…

ほえー、GBPJPY が 181 円! とりが数年前イギリスにいた頃は、高いときでも 150 円くらいだったのに。ただし、学部の頃 summer student で行ったときは 200 円前後だった。 今年は河内晩柑がもう店頭から消えてしまった。5 つで 518 円のグレープフルーツな…

国道 171 号線沿いを歩くより旧西国街道を通ったほうが近道だと教えられ、夕食は餃子の王将に行ってきた。片道 1.3 km くらい。しかし、店の広さの割にスタッフが足りていないのか、席はかなり空いてるのに案内されるまでに 30 分くらい、注文したあとも結構…

気温が 30 度を超えたようだ。室温も 29 度。扇風機を出した。シーツも洗って夏用のものに入れ替えた。 共同研究者から Google Drive で送られてきた多数のファイルをダウンロードしようと rclone を久しぶりに使ったら token が失活していた。rclone config…

読んだ Science "Tracking C–H activation with orbital resolution" Rh 錯体が octane C-H 結合へ酸化的付加する時の分子軌道の変化を XFEL による時分割 XES と量子化学計算で追求している。教科書に載っている基本的な反応機構だが、ここまで精緻に観測し…

I often see people use "don't blame me, others including you have similar problems"-kind of "logic" to defend themselves but this is absurd. It's better to criticize each other than keeping silent until everyone becomes perfect (, which ne…

身勝手な生物学者の話を聞いて精神的ダメージを受けた。 Today I enjoyed reprocessing three MicroED datasets deposited to Zenodo recently. Zenodo 7884356: Aspirin Zenodo 7884398 Ipragliflozin Zenodo 7884434 C20H13O4P Very clean data. Solved ea…

今日はこれまでより特に気温が上がったわけではないはずだが、日中、妙に暑く感じた。 Reddit の API 有料化に対する抗議運動が起きているそうだ。Wikipedia も頻繁に寄付を募ってるし、こういうトラフィックの多いサイトの運営って、サーバにどのくらいのコ…

読んだ ASCII "ロードマップでわかる! 当世プロセッサー事情 第 723 回 Aurora の性能は実質 2 EFlops で消費電力は 4500 W インテル CPU ロードマップ" 4500 W というのは、当然、システム全体ではなくノードあたりの数値だが、この記事タイトルは紛らわし…

今日は少し頭が痛かったりして、だいたい寝てた。

出張が大嫌いなとりさん、今朝は横浜に出張する悪夢を見て目が醒めた。夕方に到着してホテルのチェッインでめちゃくちゃ行列したあげく、ホテルから共同研究先のラボまでが遠いことに気づき、「うわー、嫌だー、なんで来てしまったんだ。でも今日行くのサボ…

Replying to 1, 2, 3: I wouldn't feel sad if RELION was taken over by another open-source program, but domination of black-box software is very very sad. What is worse, people are switching not only for the speed or the Web GUI but for feat…

半年ぶりくらいに試料調製をして、精神的に追い詰められた。(貴重な試料を使った)実験は嫌いだ!!!!! According to the EMDB statistics, RELION is no longer the most widely used software for SPA... I knew this day was approaching but this is sad. N…

PETS2 開発者に質問してみた I started learning PETS2. May I ask two questions? (Should I ask in the X-ray Forum?) How does PETS treat negative pixels? I see it can read signed TIFF and keep negative values, but are they treated properly? Sh…

先日まで 27 度くらいあったのに、今日は一気に気温が下がって午後には 18 度くらいになり、窓を開けていたら風が半袖には寒いくらいだった。 古い Mac Book Pro の空き容量が厳しくなってきたので、そのマシンでは使わないアプリケーション(PHENIX や Visua…

今日の生協食堂は、夕食時に副菜がほとんど売り切れていて、かぼちゃコロッケも冷奴もメニューにはあるのに在庫がなかった……。しかも、お茶も薄くてほとんどお湯だった。 Jana2020 と PETS2 は自由なライセンスでないしソースコードも非公開なので避けていた…

今日も風が気持ちの良い夜だったので、「博多ラーメンげんこつ」まで少し歩いて、高菜ラーメンと餃子を食べた。去年行った時はクレジットカードが使えなかったが、今回は使えるようになっており、現金を出さなくて良くて便利になっていた。50 円割引券ももら…

今日は快晴で、しかも風が強くて、木陰で小説を読むのが気持ちよかった。 数日前から疲れのせいか精神状態が低下気味で、ネットで話題になってる白黒つかない問題・理不尽な話とかを自分で検索してはどんどん憤りを蓄えていくという悪いパターンに入っていた…

今週は、申請書や、 GPU クラスタの設計や、論文査読や、共同研究先の学生が書いた論文原稿の大幅修正や(コレスポは向こうなんだからある程度のクオリティまで指導してから共有してほしい)、他分野の人からきた質問への回答やらなにやらで忙殺されて、自分の…

前に TL に書いたかもしれないけど、神とのチャットでまたこの話題が出たので、まとめなおし。チャットの会話を整形しただけなので、いつもより口語的。 アニメとか小説で、高校生くらいのキャラクタたちがいろいろ世界の危機に立ち向かったり、あるいは身近…