XFEL での構造解析まとめ Structures solved using XFEL

まだ論文化されていない(unpublished)ものも載せているが、それらは録音や録画がネットで公式配信されているシンポジウムなどの情報にのみ基づいている。
Last update: 2014/01/28

PDBID 蛋白質 施設 手法 分解能(Å) ソフトウェア 備考 文献
PDBID protein beamline method resolution software # of images, etc reference
3PCQ Photosystem I LCLS SFX 8.68 CrystFEL 185万枚取得、 112725枚hit(10以上のspot), 15445枚指数付け可能 Nature (2011)
4AC5 Photosystem I LCLS SFX 7.4以上 CrystFEL LCP結晶による実験。complete せず。100分で365035枚取得、1542枚hit, 265枚指数付け可能 Nature Methods (2012)
4FBY Photosystem II LCLS SFX 6.56 cctbx.xfel 4時間45分で200万shot。113632枚(5.7%)がhit(16以上のspot), 7269枚(0.4%)が指数付け可能 PNAS (2012)
4IXQ, 4IXR Photosystem II LCLS 時分割 SFX+XES 5.9 cctbx.xfel 53分で38万shot。4300枚が指数付けされ1850枚を使用 Science (2013)
4HWY Cathepsin B LCLS SFX 2.1 Cheetah+CrystFEL 400万shotから293195枚がhit, 178875枚が指数付け可能 Science (2013)
4ET8, 4ET9 Lysozyme LCLS SFX 1.9 Cheetah+CrystFEL 150万shot, 4.5%がhit, うち18.4%(0.8%)が指数付け可能。もう1つのデータセットは 200万shotで2.0% hit, うち 26.3%(0.5%) 指数付け可能 Science (2012)
4N5R Lysozyme LCLS SFX (SAD phasing) 2.1 CASS+CrystFEL 240万shot, 191060枚(8%)がhit, うち59667枚(31%)が指数付け可能 Nature (2013)
- Lysozyme SACLA SFX 1.8以上 CrystFEL 14000枚から6148枚がhit,3520枚指数付け可能 SACLA課題情報 (2013)
- Lysozyme SACLA SFX 3.2 CASS+CrystFEL S-SADシグナル検出成功。584274shotから420924hit, 43840枚指数付け可能 Acta Cryst. D (2013)
- Thermolysin LCLS SFX 1.4 cctbx.xfel - DIALS発表資料 (2013)Acta Cryst. D((2012)に関係?
- 30S ribosome LCLS SFX 6.0以上 CASS+CrystFEL 回折実験のみ Acta Cryst. F (2013)
4NC3 5-HT2B receptor LCLS SFX in LCP 2.8 Cheetah+CrystFEL 10時間で422万枚撮影(LCP 100uL, 0.3mg の蛋白質に相当)。152651枚hit(3.6%), 32819枚指数付け(21.5%) Science (2013)
- Smoothened LCLS SFX in LCP ? ? ? X-ray lasers in Biology (2013) *1
- DAGK LCLS SFX in LCP ? ? 42uL LCP, 0.2mgの蛋白質。199万枚から269799枚hit(14%)、65249枚指数付け(24%) CCP4 Study Weekend (2014) *2

とりあえず項目だけ作った。新情報のタレコミ、間違いの指摘はコメント欄へお願いします。

*1:Session 4, Vadim Cherezov氏の発表録音を参照

*2:Session 3, Serial Femtosecond Crystallography of Membrane Proteins Using the Lipidic Cubic Mesophase by Dianfan Li