XFEL (やそれに類する ERL などの技術)を使った構造生物学の方向性についてメモ。
強度を生かして:
- 超微結晶解析 (serial femtosecond crystallography: SFX)
コヒーレンスを生かして:
- 単粒子解析 (coherent diffraction imaging: CDI)
- 新しい位相決定法 (inter-Bragg spot を利用するなど)
単パルス性を生かして:
- 常温測定
- 無損傷測定 (Photosystem II, Cytochrome Oxidase)
- 時分割測定 (Photosystem II)
これらの特徴は、長所にもなり短所にもなりうる。例えば、単パルス性のおかげで無損傷測定が可能となったが、代わりに still 写真しか取れないため、積分での問題が生じている。
新しいソフトウェア開発の必要な領域としては:
- 高速・大容量な画像ストレージ
- リアルタイムの画像判断 (hit かどうかの判定など)
- SFX 用の回折画像積分手法 (CrystFEL, cctbx.xfel などがすでに実用的なレベル)
- 単粒子解析 (EM とも関係深い。勉強不足)
- 新しい位相決定法
X-ray lasers in biology | Royal Society これ、はやく録音が公開にならないかな
