scp でいちいちファイル転送するのは結構面倒。GNOME だとシェルから SSH を使ってサーバのファイルシステムにアクセスできるが、コマンドラインからマウントするには、sshfs を使う。
apt-get install sshfs でインストールした上で、
sshfs username@server:/path/to/folder /mnt/sshfs
みたいな感じ。アンマウントは、
fusermount -u /mnt/sshfs
マウントポイントのパーミッションを調節したら一般ユーザからもアクセスできるようになった。