scitbx と numpy

scitbx はビルド時に SConscript (scitbx/array_family/boost_python/SConscript
)で numpy の有無を検出しており、ない場合は RuntimeError: numpy API not available を生じるコードにコンパイルされる。したがって、scitbx のビルド後に numpy を入れても無駄である。

scitbx だけを再コンパイルするため、

libtbx.refresh 
libtbx.scons scitbx
make

としたところ治った。実際には、make だけでよさそう。